3D-tulostimessa, jossa on Bowden-ekstruuderi, ekstruuderi on kiinnitetty 3D-tulostimen runkoon ja johtaa filamentin PTFE-putken (Bowden-putki) läpi tulostuspäähän. Ilman suulakepuristimen ylimääräistä painoa kuumakeskuksessa värähtelyt estetään, puhtaat liikkeet taataan ja tulostusnopeus kasvaa.

Koska taipuisat tai hankaavat filamentit kuluttavat Bowden-putkea enemmän ja niitä on vaikeampaa käsitellä pitkän kuljetuspolun takia, Bowden-ekstruuderilla varustettua 3D-tulostinta suositellaan erityisesti perinteisten filamenttien, kuten PLA, PETG tai ABS, 3D-tulostukseen.